（一）民主議定原則和合法性原則。村民自治必須是真正的大多數(shù)村民的集體意志，而不是某個人或某些少數(shù)人的意志，且該意志不能違反法律的強制性規(guī)定?！吨腥A人民共和國村民委員會組織法》第二十條第二款規(guī)定：“村民自治章程、村規(guī)民約以及村民會議或者村民代表會議討論決定的事項不得與憲法、法律、法規(guī)和國家的政策相抵觸，不得有侵犯村民的人身權(quán)利、民主權(quán)利和合法財產(chǎn)權(quán)利的內(nèi)容”。一些農(nóng)村部分村民的土地收益權(quán)得不到保護，與人們對村民自治的模糊認識有很大的關(guān)系，其所依仗的就是村民自治制度所賦予的一些權(quán)力，其實這是對村民自治權(quán)力的濫用。在一個民主和法治的國家，任何形式的自治都不能同國家的依法行政相違抗，任何形式的自治章程都不能同國家的法律相抵觸，任何形式的社區(qū)民主決定都不能損害公民的基本權(quán)利。因此，那些同國家法律、法規(guī)和國家政策相抵觸的自治章程、村規(guī)民約以及村民民主決定都是自然無效的。村民自治必須在民主和法治的軌道上才能獲得健康發(fā)展，必須做到既要充分發(fā)揚民主又要遵守法律。
（二）平等原則。在進行款分配中，要充分保障每個集體經(jīng)濟組織成員或村民享有平等的待遇，正確地處理利益關(guān)系。之所以會出現(xiàn)剝奪少數(shù)成員或村民征地補償款分配的收益權(quán)，主要受經(jīng)濟利益驅(qū)動的影響，農(nóng)村集體經(jīng)濟組織每次的收益和征地款分配總量是恒定的，為了更多地分配集體收益，惟有通過減少應(yīng)分款人數(shù)來實現(xiàn)多數(shù)村民的利益最大化，因此，公正、公平地分配征地款是保障每個成員或村民享有土地收益權(quán)的前提。